MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natronomonas pharaonis DSM 2160

Total Repeats: 66453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007426	CGT	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800656
2	NC_007426	CGC	2	6	51	56	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
3	NC_007426	GGTCGT	2	12	62	73	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	76800656
4	NC_007426	GGT	2	6	176	181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76800656
5	NC_007426	GCC	2	6	205	210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
6	NC_007426	ACC	2	6	219	224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76800656
7	NC_007426	CCG	2	6	227	232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
8	NC_007426	GC	3	6	274	279	0 %	0 %	50 %	50 %	76800656
9	NC_007426	CGG	3	9	280	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
10	NC_007426	GAG	2	6	324	329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	76800656
11	NC_007426	GTCGGT	2	12	390	401	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	76800656
12	NC_007426	CAG	4	12	404	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
13	NC_007426	CAG	3	9	425	433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
14	NC_007426	CAA	2	6	446	451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76800656
15	NC_007426	CCG	2	6	481	486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
16	NC_007426	GTC	2	6	493	498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800656
17	NC_007426	CGCT	2	8	512	519	0 %	25 %	25 %	50 %	76800656
18	NC_007426	CCG	2	6	524	529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
19	NC_007426	GTG	2	6	532	537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	76800656
20	NC_007426	TCGCC	2	10	548	557	0 %	20 %	20 %	60 %	76800656
21	NC_007426	GC	3	6	568	573	0 %	0 %	50 %	50 %	76800656
22	NC_007426	CCG	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800656
23	NC_007426	CGA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
24	NC_007426	GCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
25	NC_007426	CGGA	2	8	759	766	25 %	0 %	50 %	25 %	76800656
26	NC_007426	CGG	2	6	782	787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
27	NC_007426	CGA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
28	NC_007426	ACC	2	6	826	831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	76800656
29	NC_007426	GCA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
30	NC_007426	AGC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800656
31	NC_007426	CGG	2	6	862	867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
32	NC_007426	CTC	2	6	888	893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76800656
33	NC_007426	GTC	2	6	915	920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800656
34	NC_007426	CGG	3	9	941	949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
35	NC_007426	CA	3	6	971	976	50 %	0 %	0 %	50 %	76800656
36	NC_007426	GGC	3	9	984	992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
37	NC_007426	CGT	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800656
38	NC_007426	AC	3	6	1024	1029	50 %	0 %	0 %	50 %	76800656
39	NC_007426	CGAA	2	8	1032	1039	50 %	0 %	25 %	25 %	76800656
40	NC_007426	GGC	2	6	1060	1065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800656
41	NC_007426	GTCA	2	8	1098	1105	25 %	25 %	25 %	25 %	76800656
42	NC_007426	AAGG	2	8	1132	1139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007426	TCT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007426	GTCG	2	8	1238	1245	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_007426	CAC	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_007426	CGC	2	6	1319	1324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800657
47	NC_007426	GTC	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800657
48	NC_007426	TGC	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800657
49	NC_007426	GAC	2	6	1445	1450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800657
50	NC_007426	CGG	2	6	1456	1461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800657
51	NC_007426	ACG	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800657
52	NC_007426	CGT	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800657
53	NC_007426	GCC	2	6	1535	1540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800657
54	NC_007426	CAA	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76800657
55	NC_007426	CGAC	2	8	1581	1588	25 %	0 %	25 %	50 %	76800657
56	NC_007426	CGA	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800657
57	NC_007426	ACGCCG	2	12	1686	1697	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	76800657
58	NC_007426	CGA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800657
59	NC_007426	CAA	2	6	1798	1803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76800657
60	NC_007426	GTC	2	6	1861	1866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800657
61	NC_007426	CCG	2	6	1886	1891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_007426	CCA	2	6	1911	1916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_007426	GCG	2	6	1917	1922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007426	GAC	4	12	1951	1962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
65	NC_007426	GAA	2	6	1969	1974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	76800658
66	NC_007426	T	6	6	2009	2014	0 %	100 %	0 %	0 %	76800658
67	NC_007426	CA	3	6	2030	2035	50 %	0 %	0 %	50 %	76800658
68	NC_007426	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800658
69	NC_007426	TGC	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
70	NC_007426	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
71	NC_007426	ACG	3	9	2135	2143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
72	NC_007426	GCCG	2	8	2181	2188	0 %	0 %	50 %	50 %	76800658
73	NC_007426	GTC	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
74	NC_007426	CGG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800658
75	NC_007426	ACG	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
76	NC_007426	CGATG	2	10	2328	2337	20 %	20 %	40 %	20 %	76800658
77	NC_007426	TC	3	6	2394	2399	0 %	50 %	0 %	50 %	76800658
78	NC_007426	ACG	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
79	NC_007426	GTC	2	6	2470	2475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
80	NC_007426	CTC	2	6	2491	2496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76800658
81	NC_007426	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800658
82	NC_007426	GTTC	2	8	2599	2606	0 %	50 %	25 %	25 %	76800658
83	NC_007426	AAC	2	6	2638	2643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	76800658
84	NC_007426	CGG	2	6	2646	2651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800658
85	NC_007426	TCA	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800658
86	NC_007426	CGA	2	6	2672	2677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
87	NC_007426	GCT	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
88	NC_007426	TCG	3	9	2813	2821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
89	NC_007426	TCG	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
90	NC_007426	GC	3	6	2964	2969	0 %	0 %	50 %	50 %	76800658
91	NC_007426	CCG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800658
92	NC_007426	TCG	2	6	2999	3004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
93	NC_007426	ACG	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
94	NC_007426	ACG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
95	NC_007426	GTC	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
96	NC_007426	TCG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
97	NC_007426	CGG	2	6	3283	3288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800658
98	NC_007426	CGA	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
99	NC_007426	GCC	2	6	3400	3405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800658
100	NC_007426	TCA	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800658
101	NC_007426	CATCGC	2	12	3498	3509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	76800658
102	NC_007426	GCT	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
103	NC_007426	GAC	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
104	NC_007426	TCG	2	6	3701	3706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
105	NC_007426	ACG	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
106	NC_007426	TCG	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800658
107	NC_007426	GCC	2	6	3814	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800658
108	NC_007426	GC	3	6	3825	3830	0 %	0 %	50 %	50 %	76800658
109	NC_007426	CGA	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800658
110	NC_007426	CGC	2	6	3872	3877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_007426	CGC	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_007426	CGCT	2	8	4016	4023	0 %	25 %	25 %	50 %	76800659
113	NC_007426	CGA	2	6	4052	4057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800659
114	NC_007426	GAGC	2	8	4060	4067	25 %	0 %	50 %	25 %	76800659
115	NC_007426	CGC	2	6	4155	4160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800659
116	NC_007426	GCGG	2	8	4239	4246	0 %	0 %	75 %	25 %	76800659
117	NC_007426	CGA	2	6	4287	4292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800659
118	NC_007426	GTC	2	6	4333	4338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800659
119	NC_007426	CGA	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800659
120	NC_007426	TC	3	6	4419	4424	0 %	50 %	0 %	50 %	76800659
121	NC_007426	GCC	2	6	4444	4449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800659
122	NC_007426	GAC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800659
123	NC_007426	CG	3	6	4501	4506	0 %	0 %	50 %	50 %	76800659
124	NC_007426	GTC	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800659
125	NC_007426	GCG	2	6	4542	4547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800659
126	NC_007426	ACG	2	6	4563	4568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800659
127	NC_007426	GGCC	2	8	4569	4576	0 %	0 %	50 %	50 %	76800659
128	NC_007426	CGG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800659
129	NC_007426	CCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800659
130	NC_007426	CGT	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800659
131	NC_007426	CG	3	6	4737	4742	0 %	0 %	50 %	50 %	76800659
132	NC_007426	GCG	2	6	4756	4761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800659
133	NC_007426	GGC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800659
134	NC_007426	TCA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800659
135	NC_007426	GTT	2	6	4924	4929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	76800660
136	NC_007426	CGCCGA	2	12	4936	4947	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	76800660
137	NC_007426	TCG	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800660
138	NC_007426	GGTC	2	8	4998	5005	0 %	25 %	50 %	25 %	76800660
139	NC_007426	CGC	2	6	5008	5013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800660
140	NC_007426	CGG	2	6	5024	5029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800660
141	NC_007426	GTC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800660
142	NC_007426	CGA	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800660
143	NC_007426	TCG	3	9	5093	5101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800660
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149	NC_007426	GCG	2	6	5241	5246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007426	GTC	2	6	5317	5322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800661
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153	NC_007426	GC	3	6	5482	5487	0 %	0 %	50 %	50 %	76800661
154	NC_007426	GGC	2	6	5489	5494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800661
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169	NC_007426	GTC	2	6	6123	6128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800661
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171	NC_007426	CCGGA	2	10	6321	6330	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
172	NC_007426	TCG	2	6	6351	6356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_007426	CGACC	2	10	6376	6385	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_007426	GCC	3	9	6415	6423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_007426	CGA	2	6	6442	6447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800662
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224	NC_007426	CCGAG	2	10	8230	8239	20 %	0 %	40 %	40 %	76800664
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242	NC_007426	TCG	2	6	8899	8904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800665
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244	NC_007426	GACCG	2	10	8928	8937	20 %	0 %	40 %	40 %	76800665
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261	NC_007426	GCT	2	6	9386	9391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800665
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263	NC_007426	CGG	2	6	9477	9482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800665
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267	NC_007426	TCG	2	6	9562	9567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800666
268	NC_007426	CGG	2	6	9585	9590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800666
269	NC_007426	GTCCC	2	10	9610	9619	0 %	20 %	20 %	60 %	76800666
270	NC_007426	TG	4	8	9655	9662	0 %	50 %	50 %	0 %	76800666
271	NC_007426	CGTCGG	2	12	9665	9676	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	76800666
272	NC_007426	TCG	2	6	9677	9682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800666
273	NC_007426	CCG	2	6	9712	9717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800666
274	NC_007426	CGA	2	6	9722	9727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800666
275	NC_007426	GAC	2	6	9798	9803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800666
276	NC_007426	TCA	3	9	9866	9874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800666
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278	NC_007426	GCC	2	6	9956	9961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	76800666
279	NC_007426	TA	3	6	9997	10002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_007426	CCGG	2	8	10035	10042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
281	NC_007426	CG	3	6	10065	10070	0 %	0 %	50 %	50 %	76800667
282	NC_007426	TCG	2	6	10078	10083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800667
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293	NC_007426	CGG	2	6	10561	10566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800668
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297	NC_007426	CGG	3	9	10671	10679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800668
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299	NC_007426	GTC	2	6	10754	10759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_007426	CG	3	6	10949	10954	0 %	0 %	50 %	50 %	76800669
301	NC_007426	TCG	2	6	11067	11072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800669
302	NC_007426	GAT	2	6	11084	11089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76800669
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311	NC_007426	TCT	2	6	11407	11412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_007426	GAT	2	6	11453	11458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_007426	CGG	2	6	12057	12062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800670
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344	NC_007426	TGA	2	6	12479	12484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	76800670
345	NC_007426	GCACA	2	10	12544	12553	40 %	0 %	20 %	40 %	76800670
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378	NC_007426	GTC	2	6	13777	13782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800672
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380	NC_007426	GCG	2	6	13799	13804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800672
381	NC_007426	GCA	2	6	13808	13813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	76800672
382	NC_007426	CGGC	2	8	13830	13837	0 %	0 %	50 %	50 %	76800672
383	NC_007426	TCG	2	6	13876	13881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800673
384	NC_007426	ACGA	2	8	13920	13927	50 %	0 %	25 %	25 %	76800673
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386	NC_007426	GCG	2	6	14039	14044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800673
387	NC_007426	CGG	2	6	14084	14089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	76800673
388	NC_007426	CCT	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	76800673
389	NC_007426	GTC	2	6	14151	14156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	76800673
390	NC_007426	CAT	2	6	14157	14162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	76800673
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392	NC_007426	GCGA	2	8	14227	14234	25 %	0 %	50 %	25 %	76800673
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